Les groupes thématiques de FOSCAO sont :
- relations CEDEAO et OSC
- alimentation, agriculture et environnement
-- les questions du genre
- - gouvernance, démocratie, et droits humains
- - santé, VIH/SIDA, et Education
- - media, télécommunications, et Technologies de l’information
- - paix et sécurité
- - recherche de politique et bases de données
- - intégration régionale, développement économique, commerce et investissement
- - jeunesse
